Утилита для передачи файлов через ssh.

Скопировать локальный файл на сервер:
scp file.gz root@server.my:/home/dir

Скопировать всё содержимое папки на сервере (рекурсивно) в локальную папку (с подробным выводом):
scp -r root@server.my:/home/dir/ /home/local/my/

Между серверами:
scp -r root@server1.my:/home/dir/ root@server2.my:/home/dir/

С указанием порта:
scp -P 9999 file.zip user@server.my:~/

-r - рекурсивное копирование (для директорий)
-C - использовать сжатие при передачи
-P - порт ssh
-P большая! и -P указывает перед ssh хостом.
-p - сохранить информацию о времени создания, модификации файла.